Institut für Systembiotechnologie

Systembiotechnologie - Ganzheitliches Verstehen biologischer Systeme

Wir verwenden experimentelle und theoretische Ansätze, um biologische Systeme ganzheitlich zu verstehen. In verschiedenen Projekten untersuchen wir Bakterien, Hefen, Pilze und sogar ganze Pflanzen auf der Systemebene mit Hilfe unserer Technologie-Plattformen. Die technologischen Spezialitäten unserer Gruppe sind isotopenbasierte metabolische Stoffflussanalyse sowie computerbasierte Simulationen von Stoffwechselwegen und metabolischen Netzwerken. In Multi-Omics Ansätzen integrieren wir metabolische Fluss-Daten mit globalen Genexpressionsprofilen (Transkriptom, RNA-Sequenzierung) und Konzentrationen intrazellulärer Metabolite (Metabolom), um unbekannte Regulationsmechanismen zu identifizieren und genetische Angriffspunkte für das Design synthetischer Zellfabriken vorherzusagen.

Forschungsprojekte

Reviews

Becker, J, Wittmann, C (2018) From systems biology to metabolically engineered cells – an omics perspective on the development of industrial microbes. Curr. Opin. Microbiol. 45:180-188. PUBMED

Schwechheimer, SK, Becker, J, Wittmann, C (2018) Towards better understanding of industrial cell factories: novel approaches for 13C metabolic flux analysis in complex nutrient environments. Curr. Opin. Biotechnol. 54:128-137. PUBMED

Dersch L, Beckers V, Wittmann C (2016) Green pathways: Metabolic network analysis of plant systems. Metab. Eng. 34:1-24. PUBMED

Kohlstedt M, Becker J, Wittmann C (2010) Metabolic fluxes and beyond - systems biology understanding and engineering of microbial metabolism. Appl. Microbiol. Biotechnol. 88:1065-1075. PUBMED